Quadrupole Time-of-Flight (QTOF) merupakan mass spectrometer dengan resolusi tinggi yang dapat digunakan untuk identifikasi unknown sample. QTOF dapat menjadi solusi dalam pengujian metabolomics, salah satunya identifikasi biormaker pada penyakit kanker.
Ubhi, et al (2016) telah melakukan studi kanker prostat menggunakan QTOF X500R. Pengujian dilakukan dengan membandingkan urin orang sehat dan urin penderita kanker prostat dan mengidentifikasi senyawa biomarker pada kanker prostat. Berikut ini alur kerja studi kanker prostat menggunakan X500R.
Gambar 1. Alur kerja studi kanker prostat menggunakan X500R
Pengujian dilakukan menggunakan QTOF X500R, selanjutnya dilakukan analisis statistikal untuk mencari biormaker kanker prostat pada urin penderita kanker menggunakan software MarkerView. Selanjutnya senyawa biomarker akan diidentifikasi menggunakan software SCIEX OS.
Dengan menggunakan pendekatan statistikal, dapat ditemukan perbedaan yang menonjol pada kedua sampel urin. Penemuan senyawa asing pada urin penderita dapat berpotensi sebagai biomarker kanker prostat. Setelah senyawa biomarker ditemukan, senyawa perlu diidentifikasi dan dikonfirmasi menggunakan software SCIEX OS.
Gambar 2. Mencari senyawa biomarker kanker prostat pada urin penderita dengan software MarkerView
Berdasarkan hasil pengujian dengan QTOF X500R akan didapatkan data XIC, spektrum MS dan spektrum MS/MS yang memungkinkan untuk identifikasi senyawa. Software akan secara otomatis mencari kemungkinan rumus formula dari senyawa. Selanjutnya senyawa dapat dikonfirmasi menggunakan ChemSpider untuk mencari kemungkinan senyawa yang paling sesuai. Berdasarkan hasil studi, ditemukan kelimpahan senyawa phenylalanine pada urin penderita kanker.
Gambar 3. Identifikasi dan konfirmasi senyawa menggunakan software SCIEX OS
QTOF X500R dapat menjadi solusi untuk penelitian kanker. Tidak hanya penelitian kanker, QTOF X500R juga dapat digunakan untuk pengujian metabolomics lain, seperti mencari biomarker pada herbal tradisional, berguna dalam pengujian makanan untuk membedakan produk adulterant, dan lain sebagainya. Jurnal Ubhi, et al (2016) dapat diunduh dengan mengetuk tombol ’download’.
Referensi
Ubhi, et al. 2016. A Simplified, Integrated Solution for Untargeted Metabolomics. SCIEX, CA, USA, 2University of Florida, FL, USA.
